A guerra dos clones se expande por toda a galáxia, e os heróis Jedi lutam desesperadamente a fim de manter a ordem e a paz. Sistemas sucumbem perante o lado negro da força e a República Galáctica está sofrendo contínua pressão dos Separatistas e seu infinito exército de dróides.
O Grande Exército da República, liderado pelos Mestres Jedi Yoda, Mace Windu, Obi-Wan Kenobi e outros, deve lutar contra o Exército dos Separatistas, para defender a união democrática e a estabilidade política da galáxia. Nos campos de batalha, eles enfrentam o ardiloso Dooku, o vingativo General Grievous e a implacável Asajj Ventress. Nos bastidores, o Senador Palpatine manipula os eventos a seu favor.